首先，从结构上来看，细菌是最简单的单细胞生物之一，具有完整的细胞结构，包括细胞壁、细胞膜、细胞质和核糖体等基本组成部分。细菌可以独立生存，并通过二分裂的方式进行繁殖。而真菌则比细菌复杂得多，大多数真菌是由菌丝构成的多细胞生物，拥有真正的细胞核和细胞器。真菌可以通过孢子繁殖，广泛存在于土壤、空气和水体中。至于病毒，它既不是细胞也不是生物，而是由蛋白质外壳包裹的一段遗传物质（DNA或RNA）组成。病毒无法独立存活，必须寄生在宿主细胞内才能复制自身。

其次，在功能方面，细菌和真菌扮演着分解者的重要角色。细菌参与有机物的分解过程，帮助循环生态系统中的营养物质；而真菌则在分解木质纤维素等方面发挥重要作用，同时许多真菌还能产生抗生素，如青霉素。相比之下，病毒的功能主要是侵入宿主细胞并利用其资源制造更多的病毒颗粒，因此病毒常常被视为有害的病原体，但也有部分病毒对生态平衡起积极作用。

最后，这三类微生物对人类社会的影响也各不相同。细菌中既有益生菌，如肠道内的乳酸菌，有助于维持人体健康；也有致病菌，如引发肺炎的链球菌。真菌方面，除了少数种类可引起疾病外，更多的是作为食物来源，比如蘑菇。然而，病毒的危害性通常更大一些，像流感病毒、艾滋病病毒等，给人类健康带来了巨大挑战。

综上所述，尽管细菌、真菌和病毒都是微小的生命形式，但它们各自独特的特性使得它们在自然界中占据着不可或缺的地位。了解这些差异不仅有助于我们更好地认识自然界的运作机制，也为医学、农业等领域提供了宝贵的参考价值。